主要為頭痛、便秘、腹瀉、頭暈、疲勞、腹痛、失眠。少見不良反應詳見藥物說明書。
據國外臨床研究報道：1374名成年患者參加了帕洛諾司瓊預防由中度或重度致吐化療引起的惡心、嘔吐的臨床研究。結果表明，帕洛諾司瓊引起不良反應的發生率及嚴重程度與昂丹司瓊或多拉司瓊相似
在其它臨床研究中，單劑量用帕洛諾司瓊0.75mg時（推薦劑量的三倍），兩名患者產生嚴重的便秘：一例為在抑制術后惡心、嘔吐研究中，患者口服10μg/kg帕洛諾司瓊；另一例為一名健康志愿者在藥代動力學研究中，靜脈注射0.75mg帕洛諾司瓊。
臨床研究過程中，化療的成年患者給予帕洛諾司瓊治療時出現一些發生率較低的不良反應，被認為是治療相關性的或因果關系不明的，這些不良反應包括：
心血管系統：
發生率1%：間歇性的心動過速、心動過緩、低血壓；發生率<1%：高血壓、心肌缺血、期外收縮、竇性心動過速、竇性心律失常、室上性期外收縮、QT間期延長。多數病例與帕洛諾司瓊的關系不明確。
皮膚：
發生率<1%：過敏性皮炎、出疹。
視力和聽力：
發生率<1%：運動病、耳鳴、眼刺激和弱視。
胃腸系統：
發生率1%：腹瀉；發生率<1%：消化不良、腹痛、口干、呃逆和（胃腸）脹氣。
全身：
發生率1%：體弱；發生率<1%：疲勞、發熱、潮熱和流感樣癥狀。
肝臟：
發生率<1%：一過性、無癥狀的AST和/或ALT、膽紅素升高。主要發生于高催吐化療的患者。
代謝：
發生率1%：高鉀血癥；發生率<1%：電解質紊亂、高血糖、代謝性酸中毒、尿糖、食欲減退和厭食。
骨骼肌肉系統：
發生率<1%：關節痛。
神經系統：
發生率1%：頭暈；發生率<1%：困倦，失眠，情緒亢進，感覺異常。
精神系統：
發生率1%：焦慮；發生率<1%：欣快感。
泌尿系統：
發生率<1%：尿潴留。
血管系統：
發生率<1%：靜脈變色、靜脈擴張。
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