目前臨床上普遍使用的低分子肝素主要有低分子肝素鈣和低分子肝素鈉。肝素鈣與肝素鈉作用相似，但肝素鈣皮下注射后不減少細胞間毛細血管的鈣膠質，也不改變血管通透性，基本上克服了肝素鈉皮下注射易致出血的副作用。
臨床上會有肝素鈣副作用小于肝素鈉的情況，所以在臨床上比較傾向使用肝素鈣藥劑，肝素鈣的價格可能要比較肝素鈉的價格高一些，不過為了身體健康著想，我們還是應該以身體為重，不要去計較錢財問題了。肝素鈉以法安明為代表，患者痛感較強；肝素鈣以速碧林為代表，患者痛感不明顯。
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