肝素在臨床的使用，依據肝素的不同，給藥的方法往往也有不同。
比如普通肝素，常常需要持續的靜脈輸入治療；而低分子量肝素，比如低分子肝素鈉，往往是皮下注射給藥，并且不需要持續給藥，只需要每隔12小時注射一次就可以。
因此，臨床上往往都是采用低分子肝素治療，這是因為低分子量肝素使用方便，并且24小時內注射2次就可以，既方便患者的行動，又減少了護理的操作。
此外，注射肝素治療的情況下，患者需要注意有沒有出血傾向的可能，比如牙齦出血或者皮下淤斑的現象，如果有需要及時告知醫生。
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