肝素保胎原理是肝素抗凝，以及有抗血栓形成的作用，可以改善子宮部位的血液供應，有利于胎盤及胎兒供血情況的改善。
還有一定的調節免疫力的作用，可以降低血管損傷引起的先兆性流產的風險。
如果孕婦有凝血、抗凝和纖溶系統功能失調或障礙，機體就會出現高凝狀態，影響子宮胎盤循環而導致胎盤的微血栓形成，引起胎盤灌注量的下降，從而引起胎盤組織缺血、絨毛梗死、蛻膜血管壞死，胎兒和母體間的物質交換受阻，就可以導致流產、早產、子癇前期等。
而肝素是抗凝劑，可以對抗這種高凝狀況，改善子宮胎盤循環，增加胎兒的血運，從而達到保胎的目的。還可以用于習慣性流產或者復發性流產。
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