肝素不是常規應用的保胎藥物，而是抗凝藥物。
一般早孕期間發生反復流產的婦女，需要進一步檢查流產的原因，早孕期間反復流產的原因主要包括父母染色體異常、母體生殖道異常、母體內分泌異常、免疫功能異常、生殖道感染、宮頸機能不全及血栓形成傾向等。還有大約一半左右是不明原因的反復流產。
而針對這些流產的原因其中母體免疫功能異常可能出現抗磷脂抗體綜合征、血小板抗體等及其他引起局部微血栓形成的原因，會引起胎盤局部微血栓形成，而影響胚胎發育，導致反復發生的流產，可以應用肝素進行抗凝治療，也有保胎的作用。
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