肝素可與血小板結合，在血小板輸注后短暫降低血小板計數。應用普通肝素也可以激活血小板并釋放血小板因子4，這是一種已知的肝素結合蛋白。
它還可以引起抗體形成和血小板減少，這本身就是肝素耐藥性的一個已知解釋。抗血小板藥物的使用會影響全血凝血試驗，包括激活凝血時間，導致對肝素的反應性增加，而使血小板快速激活的藥物或條件可降低試驗對肝素的反應，特別是在接受體外循環的患者中。血小板活性不影響aPTT或抗Xa因子水平。
凝血因子水平升高
在Covid-19和其他急性炎癥狀態的患者中， VIII 因子和纖維蛋白原水平的增加會縮短 aPTT，并且需要增加普通肝素的劑量以達到目標 aPTT，這表明產生肝素耐藥。凝血因子水平的增加不影響抗Xa因子分析。
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