抗凝血酶Ⅲ(ATIII)，是血漿中一種抗凝血酶，可抑制活化的凝血因子Ⅹa、凝血因子Ⅱa（凝血酶）、凝血因子Ⅻa等。普通肝素、低分子肝素、磺達肝素，與抗凝血酶Ⅲ結合后，可增加抗凝血酶Ⅲ與凝血因子Ⅹa的親和力，發揮抗凝血因子Ⅹa作用。
普通肝素和低分子肝素與抗凝血酶III和凝血因子結合圖示：分子量較大的肝素（分子量＞5400KD），才能與抗凝血酶Ⅲ、凝血因子Ⅱa同時結合，發揮抗凝血因子Ⅱa作用。
抗凝血因子Ⅱa作用：普通肝素＞低分子肝素，磺達肝素無抗凝血因子Ⅱa作用。
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