1. 成鹽。 稱取粗品肝素鈉 30g，向其中加入適量純化水溶解，得肝素鈉溶液；稱取芐索氯銨75g，向其中加入純化水溶解，得芐索氯銨溶液。 將芐索氯銨溶液緩慢加入到肝素鈉溶液中，邊加邊攪拌，攪拌均勻后，靜置2小時。 然后用離心機進行離心操作，將離心所得固體用純化水進行洗滌，最后將所得肝素芐索氯銨鹽濕品進行真空干燥即可得肝素芐索氯銨鹽。 [2]
2. .酯化。 向所得的肝素芐索氯銨鹽中加入5倍體積的二氯甲烷，攪拌溶解后再向其中加入肝素芐索氯銨鹽1倍體積的氯化芐，維持溫度 35℃，攪拌反應 24小時，反應結束加入肝素芐索氯銨鹽6倍體積的10%乙酸鈉甲醇溶液， 攪拌10分鐘，靜置4小時，對沉淀進行過濾，將過濾的沉淀用甲醇反復洗滌兩次得肝素芐酯濕粗品。向肝素芐酯濕粗品中加入肝素芐索氯銨鹽重量3倍體積的8%氯化鈉水溶液， 攪拌至完全溶解，再加入氯化鈉溶液體積4倍的甲醇，繼續攪拌10分鐘，靜置2小時，過濾重復此操作三次，即得肝素芐酯濕品。將肝素芐酯濕品進行真空干燥，即可得肝素芐酯。
3. 解聚。 向肝素芐酯中加入其重量20倍體積的純化水，邊攪拌邊溶解，同時升溫至60℃。稱取肝素芐酯重量10%的氫氧化鈉用純化水溶解， 然后緩慢加入到肝素芐酯溶液中，維持溫度60℃，攪拌反應2小時，然后用適量鹽酸調節溶液pH6.0~6.5，將溶液降溫至常溫，得解聚液。 向解聚液中加入適量氯化鈉，使其濃度為10%，攪拌至完全溶解，然后攪拌狀態下加入肝素芐酯重量60倍體積的甲醇， 攪拌均勻后靜置5小時，分離上清即可得依諾肝素鈉濕粗品。 [2]
4. 氧化醇沉。 向依諾肝素鈉濕粗品中加入其重量3倍體積的純化水，攪拌至完全溶解，補加純化水，使溶液濃度為20%。 然后加入溶液體積1%的氯化鈉，攪拌下，升溫至35℃，用氫氧化鈉調溶液 pH 至9.5~10.0；再加入溶液體積1%的過氧化氫（濃度為30%），維持溫度、pH，氧化8小時，得氧化液。 將氧化液經0.45μm 濾芯過濾，用鹽酸調 pH6.0~6.5，攪拌狀態下，加入濾液體積5倍的甲醇，攪拌均勻，靜置5小時，分離上清，即可得依諾肝素鈉氧化醇沉品。 [2]
5. 除菌過濾。 向氧化醇沉品中加入適量純化水，使其濃度為25%，攪拌至完全溶解后，將溶液經濾芯過濾。 將除菌過濾液經凍干機干燥，粉碎混合后即可得依諾肝素鈉精品。
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