肝素主要通過增強抗凝血酶的活性而間接發揮抗凝效果的。
肝素是一種結構復雜的，臨床上主要用于血栓栓塞疾病的治療和預防，主要通過3個方面發揮抗凝效果：
1.肝素能夠有效地抑制血小板的粘附和聚集；
2.肝素可以加強體內蛋白c的活性，刺激機體血管內皮釋放一些纖溶物質以及抗凝物質。是預防血栓形成作用的主要機制；
3.肝素可與抗凝血酶Ⅲ的一個賴氨酸殘基結合，使抗凝血酶Ⅲ與凝血酶的親和力增加100倍，使凝血酶立即失活，從而產生抗凝作用。這是肝素起到抗凝作用的最主要機制。
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