1、肝素是需要迅速達(dá)到抗凝作用的首選藥物，可用于外科預(yù)防血栓形成以及妊娠者的抗凝治療，對于急性心肌梗死患者，可用肝素預(yù)防病人發(fā)生靜脈栓栓塞病，并可預(yù)防大塊的前壁透壁性心肌梗死病人發(fā)生動脈栓塞等。
2、肝素的另一重要臨床應(yīng)用是在心臟、手術(shù)和腎臟透析時維持血液體外循環(huán)暢通。
3、用于治療各種原因引起的彌散性血管內(nèi)凝血（DIC），也用于治療腎小球腎炎、腎病綜合征、類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎等。
肝素天然存在于哺乳動物的肥大細(xì)胞和中性粒細(xì)胞中，在過去幾十年內(nèi)，歐美國家所使用的肝素原料主要從牛肺、牛腸或豬小腸黏膜中提取。然而，由于近年來“瘋牛病”的傳播，且研究表明牛來源的肝素引起血小板減少等副作用的可能性是豬來源肝素的兩倍，許多國家都更傾向于使用豬來源的肝素。
標(biāo)準(zhǔn)肝素：臨床上最初應(yīng)用的肝素稱為標(biāo)準(zhǔn)肝素、普通肝素或未分級肝素（Unfractionated Heparin），臨床上主要用于抗凝血和抗血栓，治療各種原因引起的彌漫性血管內(nèi)凝血和抗血栓，以及血液透析、體外循環(huán)、導(dǎo)管術(shù)、微血管手術(shù)等操作中的抗凝血處理等。同時，臨床應(yīng)用及研究顯示，標(biāo)準(zhǔn)肝素還具有其他多種生物活性和臨床用途，包括抗炎、抗過敏、降血脂、抗動脈粥樣硬化、抗中膜平滑肌細(xì)胞（SMC）增生、抗病毒、抗癌等作用。
低分子量肝素：為了減少肝素的易導(dǎo)致出血、血小板減少和骨質(zhì)疏松等副作用，二十世紀(jì)八十年代末歐洲首先研發(fā)出了低分子量肝素。經(jīng)大量臨床研究證實，低分子量肝素具有抗血栓作用強(qiáng)而副作用小等優(yōu)點(diǎn)，具有更為廣泛的醫(yī)學(xué)用途，成為治療急性靜脈血栓和急性冠脈綜合癥（心絞痛、心肌梗塞）等疾病的首選藥物。
由于肝素通過干擾凝血過程的若干環(huán)節(jié)實現(xiàn)抗凝血和抗血栓的獨(dú)特作用機(jī)理，其臨床應(yīng)用價值仍在不斷地被研究和開發(fā)的過程中。隨著研發(fā)力度的不斷加大，肝素對于新的適應(yīng)癥將不斷開發(fā)出來,這也將成為肝素類產(chǎn)品未來的重要發(fā)展空間。
在臨床上肝素廣泛應(yīng)用于防治血栓栓塞性疾病、彌漫性血管內(nèi)凝血的早期治療及體外抗凝。臨床應(yīng)用及研究顯示:肝素除具有抗凝作用外，還具有多種生物活性和臨床用途。
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