在臨床上，目前肝素可用來治療及預防深靜脈血栓、肺栓塞、動脈栓塞，也可用于治療心肌梗塞以及不穩定型心絞痛。通常以靜脈注射方式給藥，也可以應用在采血管以及血液透析機。值得一提的是，近幾十年來,血液透析、心肺分流術、骨科、血管和重建手術等醫學技術的不斷進步促進了直接與生物組織接觸的人工材料的迅速發展。由于任何外物與血液接觸都會導致血液產生各種應急反應,最終引發凝血,導致醫療器械的閉塞和栓塞,這極大限制了材料在醫學領域的應用。因此,提高體外循環中材料的生物相容性,特別是血液相容性是解決問題的關鍵。而肝素作為強大的抗凝物質，已經作為一種涂層應用于醫療器械領域。國外已經有多款上市產品，而國內仍處于研發階段。目前生物醫學材料表面肝素固定原理可歸納為物理法和化學法。物理法即通過機械包埋、分子鏈之間的纏繞和滲透、被有孔材料吸附等方式將肝素固定到生物材料表面，從而達到將肝素固定化的目的。化學法即通過肝素分子鏈上豐富的反應性官能基團，如磺酸基、氨基、羧基等與目標材料表面上相應的可反應基團進行反應，以離子鍵或以共價鍵的方式將之固定到生物材料表面。肝素涂層技術只是改善生物材料組織相容性和血液相容性的一個開始，相信將來更智能的生物材料或肝素涂層出現，并可與藥物涂層結合，從而最大程度地減輕對患者機體內環境和循環系統的侵擾。

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